Posted on: 2020年2月3日 Posted by: admin Comments: 0

上海科学家的“计算机发现”,有望加速新型冠状病毒疫苗研发

病毒疫苗研究都在实验室?答案是否定的。在生物信息学高速发展的今天,计算机也成为重要助力之一。

同济大学31日传出信息,该校曹志伟教授团队与上海市公共卫生临床中心合作,计算得出,新型冠状病毒(2019-nCoV)与SARS存在交叉保护表位,这一发现有望推动中和阻断抗体研发,加速疫苗研究。1月30日,相关论文在 《遗传学报》在线发表。

2019年12月以来,武汉新型冠状病毒感染引起的肺炎传播迅速,疫情紧急,研发中和保护性抗体迫在眉睫。然而抗体研发所需的关键信息-中和保护表位,尚未被揭示。

研究表明,S蛋白是冠状病毒与宿主细胞表面ACE2受体结合、进而介导病毒入宿主细胞的关键表面蛋白,是疫苗抗体研发的重要靶点。基于具有自主知识产权的免疫原性计算工具CE-Blast,研究小组对所有冠状病毒的S蛋白进行了系统性的结构模拟和免疫原性扫描,计算了新病毒与已知17种冠状病毒亚型之间的免疫原性距离,发现新病毒S蛋白的免疫原性总体上与SARS更为接近。进一步计算揭示,2019武汉新冠状病毒与SARS冠状病毒的S抗原在受体接合区域(RBD)上存在潜在交叉反应表位。

新型冠状病毒(2019-nCoV)与SARS存在交叉保护表位,这一发现有望推动中和阻断抗体研发

同济大学供图

最为重要的是,其中一处与人ACE2受体结合位点紧密毗邻。因此,针对该表位区域研发抗体,空间位阻效应可能阻断病毒与ACE2受体的结合,有望起到病毒感染保护作用。同时,针对该表位区域的SARS抗体,可能对2019新病毒具有潜在临床治疗价值。

“我们在算法上有积累,这次做得非常快,很着急,”曹教授介绍,1月15日从网上下载了相关数据, 21号结果算出来了。据了解,此次采用专有免疫计算技术进行大规模扫描,可在突发/新发传染病早期,为抗体疫苗研发提供理论提示与快速引导。

为加快新病毒抗体与疫苗研发,同济大学曹志伟团队向研发机构免费共享抗体研发相关的计算预测技术,方便各方研究团队尽早掌握疫苗抗体研究关键信息。

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